Los directores de los programas miembros se reúnen tres veces al año para discutir un amplio ámbito de temas. Gran parte de la información se traslada a los estudiantes para mejorar su experiencia en el extranjero y ayudarles así a sacar el máximo provecho a sus estudios en España. La Asociación también organiza reuniones anuales en Madrid, Barcelona y Sevilla para revisar asuntos generales sobre los estudios en el extranjero.
Asambleas generales de APUNE para el periodo 2012-2013:
- Asamblea General de Otoño- 19 de octubre, Universidad Francisco de Vitoria, Madrid.
- Asamblea General de Invierno- 22 de febrero, Schiller International University, Madrid.
- Asamblea General de Primavera- 10 de mayo, Universitat Rovira i Virgili, Tarragona.